故事发生在二十一世纪,日本依旧笼罩在德川幕府的统治之下。柳生宗朗(平川大辅 配音)家中世代经营道场,宗朗本人则肩负着成为下任当家的沉重责任。尽管身为德川家康的臣子,但宗朗对幕府的独裁以及武应学园塾对于反抗学生的暴力镇压感到十分不满。他的不满招致了飞来横祸,不仅道场面临关门大吉的命运,宗朗更是遭到了学生会派出的精锐部队的追杀。
就在命悬一线之时,一位名为柳生十兵卫(悠木碧 配音)的红发少女突然从天而降击退了敌方。原来,柳生十兵卫是宗朗的义妹,她一直在暗中保护宗朗。随后,柳生义仙(水原薰 配音)、真田幸村(钉宫理惠 配音)、后藤又兵卫(小林优 配音)等一干武江少女也陆续出现在了宗朗的身边。她们都是反对幕府统治的学生,决定帮助宗朗重振道场。
在与学生会的激战中,柳生家族的力量逐渐壮大。他们不仅击败了学生会的精锐部队,还成功阻止了幕府派来的刺客。最终,宗朗在众人的帮助下,成功地让道场重新开张。同时,他也明白了自己的使命和责任,决心继续为推翻幕府统治而奋斗。