在南国小岛上和鹰冈的决斗后，3年E班的学生们与杀老师（福山润配音）的关系更加亲近。尽管暗杀活动仍在继续，但似乎已成为师生互动和玩乐的一部分。以茅野枫（洲崎绫配音）为首的学生们又开始策划更加精彩的暗杀陷阱。此外，他们帮助比琪老师追求乌间惟臣（杉田智和配音），或者与A班精英们展开荣誉与尊严之战。与此同时，白先生带领堀部系成（绪方惠美配音）卷土重来，而神秘的死神将E班推向了危险的境地。随着最后期限一天天逼近，杀老师和学生们的关系变得愈加微妙…… 本片根据松井优征的超人气漫画改编。