故事发生在神世纪300年，结城友奈是初中2年级学生，她天天在学校里过着与很多朋友一同听课、进行社团活动、玩耍的平稳生活。不管怎么看这都是非常普通的女孩的生活日程，但是只有一点与其他孩子决定性不同的地方，那就是她所属的名为“勇者部”的社团活动。以部长犬吠埼风为中心的该社团的活动内容与被谜团包围的叫做Vertex的不可思议的存在有关系，本作正是以描写友奈等人的“勇者部”的活动为主。
在结城友奈所在的学校里，有一个名为“勇者部”的社团。这个社团的成员都是一些性格各异的孩子，他们在一起参加各种活动，共同面对挑战。其中，最引人注目的是部长犬吠埼风，他不仅勇敢而且机智，总能带领大家走向成功。
然而，这个社团却隐藏着一个令人费解的谜团——被称为Vertex的不可思议的存在。这个存在既不是人也不是物，它究竟是什么？又为何会出现在这个社团之中？这一切的背后又隐藏着怎样的秘密？
结城友奈和其他成员们一起，开始对这个神秘的Vertex展开调查。他们发现，Vertex似乎与“勇者部”的活动有着千丝万缕的联系。每当他们遇到困难时，Vertex总会给予他们指引和帮助。
随着调查的深入，结城友奈逐渐发现了Vertex的真实身份——它是一只拥有人类智慧的神秘生物。它之所以会出现在这个社团中，是为了帮助孩子们成长和发展自己的能力。而“勇者部”的活动，则是为了让孩子们学会勇敢面对困难，培养他们的团队精神和领导能力。
于是，结城友奈和其他成员们决定联手揭开Vertex的秘密。他们通过一系列的冒险和挑战，终于找到了Vertex的真正所在——一个隐藏在校园深处的秘密基地。在那里，他们看到了Vertex的真实模样——一只拥有着璀璨光芒的巨大生物。
原来，Vertex是一只守护神，它一直在默默地观察着孩子们的成长和进步。它用自己的力量保护着“勇者部”的孩子们，让他们能够在面对困难时保持勇敢和自信。同时，它也用自己的智慧帮助他们解决问题，提升自己的能力和素质。
最终，结城友奈和她的同学们成功地揭开了Vertex的秘密，也明白了它的真正目的。他们感激地接受了Vertex的帮助，并继续在“勇者部”中努力学习和成长。
从此以后，结城友奈成为了一名出色的勇者，而“勇者部”也成为了学校中最受欢迎和尊敬的社团之一。他们一起经历了无数挑战和冒险，共同书写着属于他们的传奇故事。
