故事发生在明朝末年，徽州府临源谢家是宗族团结兄弟和睦的象征，祖祠悌让堂是家族的圣地。然而，在男尊女卑的时代背景下，祠堂也是女人的禁地。故事围绕一个女人开始、发展、最终走向不可预知的结局展开。 明朝末年，徽州府临源谢家的祖祠悌让堂举行新婚大典时，祠堂突然倒塌砸伤了前谢志卿，给喜庆的两谢族人心头蒙上了不祥的阴影。戏班班主郑芝盟之女郑秀云自小与谢致成青梅竹马，却阴差阳错嫁给了谢致卿。新婚不久，致卿与致成结伴外出经商，秀云从此开始了徽州女人“一世夫妻三年半”的漫长寂寞的等待。 以秀云的公公秀才为代表的前谢，和以三爷为掌门的后谢一直在为宗祠的掌祠权而明争暗斗。秀才屡试不第，遂将耀祖光宗的全部希望倾注到被乡邻目为神童的小儿子致相身上。后谢三爷虽然自己有三个儿子，却仍将长房长孙谢致成视如栋梁，倾力培养。二谢的争斗随着后谢三爷家老三谢格非的中举而渐趋明朗。 秀云遭遇到一个个不平凡的生活考验，她持家的重担过早地落在才二十出头的秀云身上；小叔致相因为生病而在生活上养成了对她极度的依赖；被找回来的玉芬因触犯族规，要被处以“沉江”的刑罚；丈夫致卿出门八年，归家时却带回一个姿容艳丽的小妾和一个才会走路的儿子；致相中举；秀才失疯；玉芬女扮男装进入戏班；而致卿却在生意最得意之时遭逢不测。岁月流逝，悌让堂在两谢轮流主持下迎来一个个告安祈福的祭典，接纳一个又一个或光荣或平淡走完他们人生旅程的谢氏族人，与此同时，被挡在祠堂外的女人们也在默默的等待、辛苦的劳作与无言的祈望中耗干了青春丰腴的姿容，熬白了缕缕青丝。 二十年弹指而过，耄耋之年的秀才公公倾十数年心血修撰的谢氏统宗谱终于告成，前谢族人大喜之际，年过七十的三爷却集合起后谢族人对新谱口诛笔伐，誓言要将谢家历史上所有未决之疑统统做一归结。两谢正为此打得不可开交，已是大富商的致成从外面回来，告诉乡人，李闯王进了北京，崇祯帝以身殉国，满人铁骑踏入山海关了。 一生未出过远门的乡民们对国家前途忧心忡忡，莫衷一是，这时，八年前忠勇殉国战死在北方前线的致相突然死而复生，出现在秀云面前。喜悦与激动过后，谢家人才知道致相做了满人任命的徽州知府，带回了满人的第一道政令：剃发。 两谢的血性后生要杀致相为族除逆，三爷与秀才则为了谢氏一族的安危存亡进退两难。一场史无前例的盛大祭典成为谢氏一族向祖宗最悲情的告白，一场冲天大火烧掉了两谢始祖兄弟亲手奠基的悌让堂，送走了一个忠淳敬朴的时代，也为后世埋藏了一段渐渐被改写了的历史真相。 故事至此并未结束，秀云才葬了公公，忽然又得到清朝皇上的旌表，这当然是致相努力的结果，秀云领旨谢恩，将几个孩子托付给致成，并与他定下来生之约，而后只身前往府城，来见致相…… 个人、家庭、宗族和国家，欲望、道义、荣辱、情仇和生死。《大祠堂》昭示了中华民族的连绵不绝、中华文明的生生不息。《大祠堂》代表了文化的无尚价值、也代表了生命的超越永恒。 《大祠堂》涉及复杂多样的人际伦理：恋人、叔嫂、夫妻、父子、妻妾、主仆、朋友和兄弟，在朴素平实和流畅自然之中讲述惊天地泣鬼神的动人故事。