在这个故事中，神敬太郎博士因为其卓越的人类工学技术被神秘组织GOD看中，并被迫加入。然而，他拒绝了这个提议，结果遭到了袭击。他的独子神敬介也在事件中丧生，并且身受重伤。为了救回儿子的生命，神敬太郎不顾自己的伤势，亲自进行了一场手术。 当敬介醒来时，他发现他的父亲已经去世了。通过父亲的计算机留言，敬介得知了GOD企图危害世界的真实意图。因此，他决定承担起对抗邪恶的责任，成为了假面骑士X，肩负起了守护世界的重任。