在第五季的结尾,杰克(基弗·萨瑟兰 Kiefer Sutherland 饰)意外被中国秘密逮捕,经历了长达20个月的关押。在这期间,他忍受了非人的严刑拷问,但始终保持沉默。而此时,美国却遭受到恐怖分子炸弹袭击的威胁,证据显示这些袭击可能是由伊斯兰教派武装组织所为。CTU方面调查发现,这一系列恐怖袭击的背后主使是一个名叫阿萨德的伊斯兰恐怖分子。为了能顺利实施针对阿萨德的刺杀计划,美国和中方交涉,换回了被关押的杰克•鲍尔。
杰克本打算利用自己作为诱饵,引出阿萨德。但在引诱阿萨德的过程中,他却发现了这次恐怖袭击的幕后主使另有其人。为了化解即将到来的恐怖袭击,杰克再次挺身而出,只身与恐怖分子展开了较量。最终,他成功揭露了幕后主使的身份,并协助美国和我国共同挫败了这次恐怖袭击。