在2031年，由于作为次世代能量装置而开发的“量子反应堆”的暴走事故，世界发生了剧变。突然从地下蔓延的闪光，吞噬了都市楼群、覆盖了大地，最终，一种超越、融合了生物、机械、植物的未知特异进化生物“B.R.A.I”出现了。
7年后，翔龙重生为绝对防卫都市“新翔龙”。它以惊人的速度完成进化，并成为与陷人类于灭亡危机的B.R.A.I相对抗的人类最后的希望要塞。
被命运所引导而集合在新翔龙的雷昂、可依、坤灵、道格。将他们迎入防卫军的塞西尔、凯恩、杰、格伦。于是，赌上人类存亡而战的特殊部队“潘多拉”诞生了。
契约之时，希望被托付给了他们——
雷昂：为了保护人类的未来，我必须战胜B.R.A.I。
可依：我相信我们的力量可以战胜任何困难。
坤灵：我会用我的智慧和力量帮助大家。
道格：我们将团结一致，共同面对挑战。
塞西尔：为了保卫家园，我愿意付出一切。
凯恩：我将带领大家走向胜利。
杰：我会用我的勇气和决心来鼓舞大家。
格伦：我们将一起创造属于我们的未来。
