在22世纪末，地球面临前所未有的危机：被人类称作“加米拉斯”的不明外星生物盘踞火星，并持续向地球发射带有强烈放射性物质的游星炸弹。这些炸弹不仅摧毁了城市，还使地球人死伤无数，濒临灭绝。面对绝境，人类被迫转移到地下求生。
在这关键时刻，一支由勇敢的宇宙舰队组成的远征队踏上了前往火星的旅程，试图阻止加米拉斯的行动。然而，他们几乎全军覆没，侥幸逃回的大和号成为了人类最后的希望。
与此同时，一个神秘装置穿越万里银河坠落地球。经检测发现，该装置竟然能消除放射性物质。为了从装置的主人——麦哲伦星云伊斯坎达尔星的高智慧生物那里寻求帮助，人类决定孤注一掷，派遣大和号进行这次远征。
火星之战中失去哥哥的原宇宙舰队成员古代进（木村拓哉饰）应召归队，和一众好友成为了见证伟大历史时刻的一员。而得知人类动向的加米拉斯也发起了一波波的致命攻击……
本片根据松本零士的同名原著改编，展现了人类在绝境中的奋斗与勇气，以及对外星生命的尊重与理解。
