在一个遥远的星球上，有一个被称为火星的地方。在火星上，人们发现了一个神秘的箱子，这个箱子被命名为“潘多拉魔盒”。当这个魔盒被打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。 被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、手上握着不可思议的瓶子。 这位青年名叫天才物理学家，他拥有变身的能力。当他看到Smash的出现时，他立刻变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前。 Smash是一个强大的敌人，它的力量强大无比。然而，天才物理学家并不畏惧，他用自己的智慧和勇气与Smash展开了一场激烈的战斗。最终，天才物理学家成功地击败了Smash，拯救了人类。 这场战斗让天才物理学家成为了人们心中的英雄，他的名字也被传颂千古。从此以后，人们都知道了一个勇敢、聪明、机智的年轻人——天才物理学家。