为了庆祝最疼爱的小老弟（克里斯多夫·奈茨 Christopher Knights 配音）的生日，老大（汤姆·麦格拉思 Tom McGrath 配音）带领菜鸟以及好搭档科斯基（克里斯·米勒 Chris Miller 配音）、瑞哥闯入了防守严密的美国黄金储备中心，寻找那台销售炸薯条的自动贩卖机。然而，他们刚完成任务不久，就被贩卖机吞进了一个神秘的场所。在全封闭的环境中，四只企鹅遇见了伪装成基因遗传科学家的章鱼戴夫（约翰·马尔科维奇 John Malkovich 配音），他原本是动物园里的明星章鱼，但当萌态十足的企鹅们出现后，他陷入了绝望。因此，戴夫潜心研究出了可怕的血清，发誓要向所有他曾待过的动物园中的企鹅展开报复。
老大和伙伴们在逃亡途中得到了北风特工队的救助，而他们将分别阻止戴夫的阴谋。
