新干线超进化研究所为了守护日本的未来，开发了名为“新干线变形机器人SHINKALION”的先进武器。这些机器人由适合成为驾驶员的孩子操控，与研究所成员一起对抗强大的敌人。然而，“漆黑新干线”的真正目的是什么？孩子们能否成功守护日本的未来呢？让我们拭目以待！