幽灵军团的黄泉，通过神秘的暗黑医疗术复活了魔物魍魉。他希望以此建立黑暗的千年王国，企图杀害巫女紫苑，并夺回魍魉在沼之国的肉体。鬼之国遇袭的消息很快传到其他各国，忍者也被调动起来保护紫苑。然而，鸣人却从紫苑口中得到他将死去的预言……本片为《火影忍者》第四部剧场版动画。