秦明（张耀 饰）初入职场，为了调查母亲遇害的谜团而意外卷入了一宗凶杀案。在这个过程中，他结识了安然（汤敏 饰）、林涛（彭楚粤 饰）、环环（马昕墨 饰）等一众法医和警员。剧集以《法医秦明》系列的第一部作品为蓝本，深入探讨每一个案件背后隐藏的社会问题，同时揭示了一个巨大阴谋的千丝万缕的联系。