在现实世界中，搭档望月芽心被一个拥有神秘外表的玄内模样的男子所伤，导致缅因猫兽再次暴走。这个被认为拥有毁灭世界的能力的怪兽，正是从现实世界消失的歪曲本身。西岛大吾和出现于望月博士处的黑客兽逐渐揭开了真相。为了保护世界平衡，保证恒常性，他们决定将过于强大的缅因猫兽切除。随着暴走的缅因猫兽的出现，现实世界开始进入毁灭前的倒计时。 与此同时，因歪曲而现身的数码宝贝们也等待着那一时刻的到来。被选召的孩子们因为与他们的搭档数码宝贝在一起而遭到人们的追赶，陷入孤立无援的境地。然而，他们仍然拼命地寻求对策。与此同时，芽心独自一人持续烦恼着。同伴和数码宝贝的声音都无法传达到她心中，因为她背负着过大的负担并遭受打击。 最终，残酷的命运甚至逼近了灵魂比任何人都率直纤细的八神光身边。