何天心是一个容貌清秀、个性叛逆、热心助人且活泼可爱的女孩，她从父亲那里学到了一些医术，并因此被称为“小华陀”。为了学习正统的宫廷医术，她决定伪装成男性进入皇宫。在宫中，她结识了假太监张哲三和皇帝朱历，三人一同经历了镇南王叛乱和汪公公的迫害，每次都依靠自己的机智和高超的针灸医术化险为夷。 尽管平时与张哲三打打闹闹，何天心并没有意识到自己对张哲三的感情。直到张哲三为了保护她而受伤，天心才意识到两人之间早已存在深厚的感情。然而，当何天心的身份被揭露后，皇上多次为她解围，但天心却将皇上当作好兄弟，因为她已经深深地爱着张哲三。 然而，张哲三却因为一些误解而未能成为护卫，反而变成了太监。刘一刀在一次配药时失误，误伤了张哲三的大腿。幸运的是，刘一刀及时收回了刀，但张哲三从此成为了太监——小三子。 在陪伴天心回乡为穷苦民众免费诊疗之后，张哲三逐渐改变了对她的看法，甚至产生了好感。他不顾生命危险也要保护天心。由于镇南王事件中立功，张哲三恢复了男儿身，成为了御前带刀侍卫。在救出水灵公主溺水的过程中，水灵公主对他产生了好感。 得知皇上对天心的爱慕之情后，张哲三自觉无法承担起天心的责任，便将这份感情深深埋藏心底。然而，这种若即若离的态度同时牵动着天心和水灵公主的心。在得知天心是女儿身后，张哲三故意隐瞒自己的感情。 天心的机智和勇气不仅帮助皇上赢得了宫中人心，也逐渐让他对天心产生了感情。当皇上发现张哲三对天心有情时，他不顾太后反对，执意要立天心为后。三人之间的关系逐渐变得微妙起来……与此同时，汪公公发现皇上与天心、张哲三联手巩固朝中势力，于是密谋伪造天文凶象，企图逼迫皇上退位。年轻的皇上能否抵挡住这些挑战，保住自己心爱的人呢？