在地球遭受一颗陨石撞击后，另一半的星球上的生灵们在日益恶化的生态环境中挣扎求生。斯凯普林管道公司在地下挖掘过程中意外打通了两个世界之间的通道。马里奥和鲁基兄弟原本是管道工，因戴西被捕而一同进入岩层，来到了由库帕控制的异世界。 库帕利用他的机械能力随意操控生物的进化或退化，而能够统一两个世界的正是戴西手中的陨石碎片。兄弟二人凭借他们的专业技能，帮助戴西的父亲复原并稳定了混乱的局面。他们运用智慧和勇气，不仅保护了自己的家园，也维护了两个世界的和平。