这是一个关于弑神者的故事，他们拥有杀死神灵的能力。草薙护堂是一个普通的高中生，他偶然打败了军神，继承了他的能力，从此走上了一条弑神的道路。与此同时，少女艾丽卡、巫女万里谷祐理等人也发现了自己的能力，并逐渐意识到只有团结起来，才能战胜强大的敌人。