《神医》是一部耗资300亿韩元制作，是韩国第一部3D电视剧。故事发生在高丽时代，王的护卫部队护送元朝公主和高丽的新王恭愍王回高丽的路上，被奇辙派人阻挠。不幸遭到行刺的元朝公主受伤，生死有关高丽国家存亡。为了救回元朝公主，求得“神医”崔莹借由华佗离开的“天门”，在2012年遇到正在作讲座的现代女医生柳恩秀。因为柳恩秀能治愈和元朝公主一样的伤，所以崔莹就将全恩秀带回了高丽。恩秀一直以为自己是在拍摄影视的摄影取地之中，在救活了元国公主，心想回家，却不知道自己从此卷入了高丽的政治阴谋中。而她和崔莹之间也在接触中渐渐产生了感情。两人将面临怎样的遭遇，而最后，恩秀是选择回到现代生活，还是为了崔莹放弃一切留在高丽？