国立爱丽丝研究机关学园本部是一所特殊的学校，它只招收具有特殊能力的学生。这种能力被称为“爱丽丝”。因为好友今井萤（钉宫理惠 配音）转学从乡间来到了城里的爱丽丝学园，无论如何也不想和萤分开的佐仓蜜柑（植村加奈 配音）因此离家出走，跟随萤来到了学园。 但是，蜜柑并没有超能力，无法进入学园。学院老师鸣海先生（石田彰 配音）发现她后，便救助了她，并意外地开发了蜜柑的超能力。于是，蜜柑也进入了爱丽丝学园，达成了她和萤在一起的愿望。 新学校的生活有喜有忧。蜜柑所具备的超能力被同学嗤笑为最无用能力，和其搭档的又是问题少年日向枣（朴璐美 配音），不能见相依为命的爷爷。在各种挫折困难面前，蜜柑依然乐观应对，逐渐赢得了大家的喜欢，也收获了和枣的爱情。但前路依旧有各种困难在等着他们……