在神盾局的危机之后，尼克·弗瑞允许寇森重建组织并恢复秩序。为了建立与政府机构的信任，寇森不仅招募新人，还致力于清除“九头蛇”的残余势力。他带领团队在全球进行搜索，寻找“九头蛇”余党的痕迹。而昔日的伙伴沃德，因背叛成为他们唯一的线索。 然而，寇森发现自己在复活期间产生了“副作用”，自控能力逐渐减弱。他频繁地刻墙图，甚至派遣队员去送死，导致神盾局面临更大的危机。更令人惊讶的是，斯凯的父亲突然回归，身后还有一个从未见过的“异人”组成的联盟。这让斯凯对自己的身世和选择感到困惑，陷入了家庭与伙伴之间的抉择困境。