小智（松本梨香 配音）和他的伙伴们，在前往下一个城镇的旅途中迷失了方向。他们口渴难耐，在荒野中遇到了巡回表演的美丽少女洋美（真锅かをり 配音）和她所在的玛丽娜剧团。洋美是水之民的后代，此行的目的是将曾被海盗凡顿•绰普（藤冈弘 配音）夺去的苍海王子的蛋送回海之神殿，神殿内则藏着水之民的珍宝——海之王冠。邪恶贪婪的凡顿岂能甘心失败，他将与洋美、小精灵护林员杰克（山寺宏一 配音）以及小智一行展开激烈的正邪争夺战…… 本片为神奇宝贝系列第九部电影剧场版。