在新的一辑故事中，女娲大神为了造福苍生，创造了神兵兽和神兽。然而，黑暗势力元始天魔却企图利用他们的力量，将「山外山」的五大守护圣兽引入危险之地。 天魔希望通过神兵小将的纯洁和正义，获得这些圣兽的信任，并将他们的圣洁力量交给问天和天晶兽。然而，他并未意识到，这将给他们带来巨大的危险。 无敌盟主看准时机，从他们身上夺取圣兽的力量以解除封印，美丽的宇宙随即陷入被毁灭的恐慌之中。 在「山外山」旅程后，「神兽之乡」的旅程又拉开帷幕。神兽们来到神兽学校修炼，却卷入了一场布偶战争之中——布偶王子想让所有神兽变成木偶！ 经过详细的调查，发现外表邪恶的布偶王子竟是宽容与纯真的兄弟。幕后主使的坏蛋三兄弟和盖世太保（把宽容等人的三兄弟分散的邪恶神兽）在布偶王子背叛他们后趁机绑架了布偶王子。 他们一行人必须克服这次困难，才能保护神兽和人类的和平。