帕丁顿（本·卫肖 Ben Whishaw 配音）回到了他心爱的家乡秘鲁，去看望他的露西婶婶（艾美达·斯丹顿 Imelda Staunton 配音）。露西婶婶现在住在一个名叫“退休熊之家”的地方。然而，一个谜团将帕丁顿和布朗一家卷入了一个意想不到的惊险旅程。他们从亚马逊雨林出发，一路经过崎岖的山路，最终来到了秘鲁山巅。在这段旅途中，他们遇到了各种奇妙的生物和风景，也经历了许多令人紧张刺激的时刻。最终，他们成功地解开了谜团，为帕丁顿和布朗一家带来了一段难忘的经历。